从微生物、食用菌和药用菌、动植物中分离纯化各类酶和生物活性物质，鉴定各类酶和生物活性物质的化学结构，研究各类酶和生物活性物质的生理药理活性和保健功效及其作用机制，解析各类酶和生物活性物质的生物合成途径，克隆分离各类酶和生物活性物质的生物合成基因（基因簇）并进行基因功能解析和鉴定，构建高产各类酶和生物活性物质的微生物基因工程菌株、代谢工程菌株、合成生物学工程菌株，发酵培养微生物及其各类工程菌株，大规模工业化生产各类酶和具有生理药理活性和保健功效的各类生物活性物质，开发成功能保健食品、特殊医学用途食品、食品添加剂、食品配料、化妆品、药物药品、兽药、鱼药、饲料添加剂、酶制剂等生物制品和生物制剂。